Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Npm1Q61937 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Npm1Q61937 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms