Protein–RNA interactions for Protein: Q61817

Creb3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3Q61817 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Creb3Q61817 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms