Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga6Q61739 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga6Q61739 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms