Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Cacna1eQ61290 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Cacna1eQ61290 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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