Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cln3Q61124 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms