Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gbp4Q61107 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms