Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Klf3Q60980 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Klf3Q60980 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms