Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rbbp4Q60972 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms