Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Neurod1Q60867 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Neurod1Q60867 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms