Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Traf3Q60803 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Traf3Q60803 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms