Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a1Q60737 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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