Protein–RNA interactions for Protein: Q60715

P4ha1, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha1Q60715 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P4ha1Q60715 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P4ha1Q60715 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P4ha1Q60715 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms