Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Samhd1Q60710 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samhd1Q60710 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms