Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Satb1Q60611 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms