Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms