Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW46

Lpo, Lactoperoxidase, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LpoQ5SW46 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LpoQ5SW46 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LpoQ5SW46 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms