Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Bbs12Q5SUD9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms