Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psme4Q5SSW2 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Psme4Q5SSW2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms