Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

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Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim58Q5NCC9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Trim58Q5NCC9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Trim58Q5NCC9 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Trim58Q5NCC9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim58Q5NCC9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Trim58Q5NCC9 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Trim58Q5NCC9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim58Q5NCC9 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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