Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim41Q5NCC3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim41Q5NCC3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim41Q5NCC3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim41Q5NCC3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms