Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps41Q5KU39 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps41Q5KU39 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms