Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

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Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp28Q5I043 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp28Q5I043 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms