Protein–RNA interactions for Protein: Q5EG47

Prkaa1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkaa1Q5EG47 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prkaa1Q5EG47 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prkaa1Q5EG47 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms