Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Pdp2Q504M2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pdp2Q504M2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms