Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

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Length 840 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx25Q3ZT31 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Snx25Q3ZT31 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Snx25Q3ZT31 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx25Q3ZT31 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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