Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim80Q3V061 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Trim80Q3V061 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim80Q3V061 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms