Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ttc9Q3V038 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms