Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms