Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SbsponQ3UPR9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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