Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Skap2Q3UND0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Skap2Q3UND0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms