Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc33Q3ULW6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms