Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lmod2Q3UHZ5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod2Q3UHZ5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms