Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Fam35aQ3UEN2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Fam35aQ3UEN2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms