Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Trafd1Q3UDK1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trafd1Q3UDK1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms