Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atxn7l3bQ3UD01 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms