Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms