Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Hvcn1Q3U2S8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hvcn1Q3U2S8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms