Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rnf149Q3U2C5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Rnf149Q3U2C5 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Rnf149Q3U2C5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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