Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc9Q3U0M1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trappc9Q3U0M1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms