Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pbxip1Q3TVI8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pbxip1Q3TVI8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms