Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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