Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc136Q3TVA9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms