Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gdpd4Q3TT99 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gdpd4Q3TT99 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms