Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc102aQ3TMW1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms