Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms