Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms