Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX6

Fubp3, Far upstream element (FUSE)-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fubp3Q3TIX6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fubp3Q3TIX6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms