Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fam107bQ3TGF2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fam107bQ3TGF2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fam107bQ3TGF2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fam107bQ3TGF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fam107bQ3TGF2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Fam107bQ3TGF2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fam107bQ3TGF2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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