Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Prr27Q3SYJ2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Prr27Q3SYJ2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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