Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Colec11Q3SXB8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Colec11Q3SXB8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms